Bilindiği üzere annenin sağlığı bebeğinin sağlığını her zaman doğrudan etkilemektedir ve aynı zamanda gebe kalmadan önceki vücut sağlığının bile fetüs üzerinde etkileri vardır. Hamileliğin ilk günlerinde oluşan nöral tüpler bebeğin beyin gelişimi için oldukça önemlidir. Bununla birlikte annenin yaşı, kaç kez doğum yaptığı, antibiyotik kullanımı, beslenme tarzı, geçirdiği enfeksiyonlarda bebeğin beyin sağlığı için önem taşımaktadır.Annenin sezaryen ile doğum yapması bebeğin anne rahminden geçerken yararlı mikroorganizmaları vücuduna kazanmasını ve bağışıklılık sistemininin güçlenmesini engellemekte olup aynı zamanda sezaryen dikişlerinin enfeksiyon kapmaması için kullanılan antibiyotiklerin yine anneden bebeğe geçerek bebeğin mikrobiyotasını olumsuz etkilediği kanıtlanmıştır.Anne sütü ile beslenen bebeklerin mikrobiyotasında Clostridiales ve Lactobacillales cinsi bakterilerin oranı mama kullanan bebeklere oranla daha yüksek olduğu kanıtlamıştır. Aynı zamanda anne sütünün içeriği bebeğin mikrobiyotasında bir nevi probiyotik görevi görmektedir. Bununla birlikte anne bebeğini emzirirken bebeğinin ihtiyacı olan güven duygusunu sağlamaktadır. Tüm bunlar ile bebeğinin beyin sağlığı olumlu yönde etkilenmekte ve nörolojik hastalıklardan bebeği korumaktadır.Doğum şekli, anne sütü, annenin mikrobiyotası, annenin doğum yaşı gibi birçok faktör bebeğin mikrobiyotasının oluşumunda etken iken bu faktörlerden bir ya da birkaçının etkisi ile mikrobiyotanın yararlı mikroorganizmalardan oluşan oranındaki dengesizlik ve bebeğin bağışıklık sistemindeki zayıflık ile oluşan sitokinler; bebeğin öğrenme, hafıza ve nöronal gelişimini etkilemektedir.
